structure
P04591 False
    Home Help About           view:Sequence FeatureTable           gene: gag gag-pol env tat nef rev vif vpr vpu           Search
offset
HV1H2 sequence
Number of mutations for residue
chain
domain
short sequence motif
ELM
peptide
site of interest
initiator methionine
lipid moiety-binding region
modified residue
secondary structure ( + details )
PDB
Intrinsic disorder score
?
 
|1
|51
|101
|151
|201
|251
|301
|351
|401
|451
|500
M
G
A
R
A
S
V
L
S
G
G
E
L
D
R
W
E
K
I
R
L
R
P
G
G
K
K
K
Y
K
L
K
H
I
V
W
A
S
R
E
L
E
R
F
A
V
N
P
G
L
L
E
T
S
E
G
C
R
Q
I
L
G
Q
L
Q
P
S
L
Q
T
G
S
E
E
L
R
S
L
Y
N
T
V
A
T
L
Y
C
V
H
Q
R
I
E
I
K
D
T
K
E
A
L
D
K
I
E
E
E
Q
N
K
S
K
K
K
A
Q
Q
A
A
A
D
T
G
H
S
N
Q
V
S
Q
N
Y
P
I
V
Q
N
I
Q
G
Q
M
V
H
Q
A
I
S
P
R
T
L
N
A
W
V
K
V
V
E
E
K
A
F
S
P
E
V
I
P
M
F
S
A
L
S
E
G
A
T
P
Q
D
L
N
T
M
L
N
T
V
G
G
H
Q
A
A
M
Q
M
L
K
E
T
I
N
E
E
A
A
E
W
D
R
V
H
P
V
H
A
G
P
I
A
P
G
Q
M
R
E
P
R
G
S
D
I
A
G
T
T
S
T
L
Q
E
Q
I
G
W
M
T
N
N
P
P
I
P
V
G
E
I
Y
K
R
W
I
I
L
G
L
N
K
I
V
R
M
Y
S
P
T
S
I
L
D
I
R
Q
G
P
K
E
P
F
R
D
Y
V
D
R
F
Y
K
T
L
R
A
E
Q
A
S
Q
E
V
K
N
W
M
T
E
T
L
L
V
Q
N
A
N
P
D
C
K
T
I
L
K
A
L
G
P
A
A
T
L
E
E
M
M
T
A
C
Q
G
V
G
G
P
G
H
K
A
R
V
L
A
E
A
M
S
Q
V
T
N
S
A
T
I
M
M
Q
R
G
N
F
R
N
Q
R
K
I
V
K
C
F
N
C
G
K
E
G
H
T
A
R
N
C
R
A
P
R
K
K
G
C
W
K
C
G
K
E
G
H
Q
M
K
D
C
T
E
R
Q
A
N
F
L
G
K
I
W
P
S
Y
K
G
R
P
G
N
F
L
Q
S
R
P
E
P
T
A
P
P
E
E
S
F
R
S
G
V
E
T
T
T
P
P
Q
K
Q
E
P
I
D
K
E
L
Y
P
L
T
S
L
R
S
L
F
G
N
D
P
S
S
Q
Gag polyprotein
Matrix protein p17
Capsid protein p24
Nucleocapsid protein p7
p6-gag
Nuclear export signal
Nuclear localization signal
PTAP/PSAP motif
LYPX(n)L motif
Spacer peptide p2
Spacer peptide p1
Cleavage; by viral protease
Cleavage; by viral protease
Cleavage; by viral protease
Cleavage; by viral protease
Cleavage; by viral protease
Removed; by host
N-myristoyl glycine; by host
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Click on orange bars in mutation barplot or residue in sequence for detailed mutagenesis information for a residue. All data is mapped to the HXB2 isolate.
Citation : Davey NE*, Satagopam VP*, Santiago-Mozos S*, Villacorta-Martin C, Bharat TA, Schneider R, Briggs JA.
The HIV Mutation Browser: A Resource for Human Immunodeficiency Virus Mutagenesis and Polymorphism Data.
PLoS Comput Biol. 2014 Dec 4;10(12):e1003951. [PubMed | PLoS ]

If you have any feedback/suggestions or bugs please contact feedback@hivmut.org